Les stations d’épuration rejettent dans les rivières urbaines des eaux résiduaires contenant des pathogènes bactériens, viraux et des parasites. Pour évaluer cette pollution, certaines bactéries du microbiote intestinal sont suivies quotidiennement pour gérer l’ouverture des zones de baignade et minimiser les risques pour les baigneurs.

Les bactéries (Escherichia coli et les entérocoques intestinaux) sont analysées par culture en microplaque (objet présenté), avec la technique du nombre le plus probable.